在这部电影中，孩子们眼中的世界展现得很美。父母双亡的小玛丽(KateMaberly饰演)来到苏格兰与亲戚同住。这是一个美丽而又有些神秘的庄园，尤其是秘密花园在玛丽心中是一个大谜。原来，玛丽的姑姑曾经死在她的花园里，从那以后，她的叔叔就一直锁着花园的门。玛丽无意中发现了钥匙，打开了花园的门。从那时起，这座花园就成了玛丽和自然完美融合的圣地。玛丽还带来了坐了很久轮椅的表妹科林(HeydonProwse Heydonprowse)。他原本封闭的视野在神奇的大自然面前豁然开朗，而他的朋友狄康(AndrewKnott)在这里与他的鸟类朋友聊天，而秘密花园的大门通向孩子们心中的天堂...