出现在太平洋的美丽岛屿:“上帝之岛”。在岛上世代相传，有一个传说说“海底宫殿”的古代遗迹正在海底沉睡，两个女海盗“安妮·伯妮”和“玛丽·里德”在那里留下了300年前就存在的宝藏”...柯南和他的一行人来到岛上度假，而“寻宝者”聚集在这里寻找宝藏(海盗猎人:在现代，在世界各地寻找过去被海盗埋藏的宝藏的人通常被称为“寻宝者”。)我们到处都遇到寻宝者。然而，在探索海底宫殿时，一名寻宝者被鲨鱼袭击后死亡。由于出了问题，柯南开始和阿希哈拉等人一起调查。柯南用他的推理逐一解决了寻宝者的谋杀和寻宝传说。最大的谜团在于“海盗旗”(海盗旗:这是18世纪水手最不想看到的东西)。它绘有骷髅，代表海盗旗。秘密在哪里？这一次，高潮阶段被转移到了海底宫殿。